MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli SE11 plasmid pSE11-4

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011407	GAA	2	6	220	225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916807
2	NC_011407	ATT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916807
3	NC_011407	TGG	2	6	338	343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011407	T	6	6	345	350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011407	TGG	2	6	436	441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011407	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916808
7	NC_011407	AAT	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916808
8	NC_011407	TCA	3	9	561	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
9	NC_011407	TCCATA	2	12	680	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
10	NC_011407	TTA	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916808
11	NC_011407	ACA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916808
12	NC_011407	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	209916808
13	NC_011407	ATC	2	6	1031	1036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
14	NC_011407	TCA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916808
15	NC_011407	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209916809
16	NC_011407	CGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916809
17	NC_011407	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916809
18	NC_011407	CAA	3	9	1478	1486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209916809
19	NC_011407	T	6	6	1598	1603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011407	CGTTCC	2	12	1668	1679	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	209916810
21	NC_011407	CT	3	6	1718	1723	0 %	50 %	0 %	50 %	209916810
22	NC_011407	TCTG	2	8	1760	1767	0 %	50 %	25 %	25 %	209916810
23	NC_011407	TGC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
24	NC_011407	CTG	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
25	NC_011407	TCT	2	6	1851	1856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
26	NC_011407	GCT	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
27	NC_011407	CTG	2	6	2010	2015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
28	NC_011407	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
29	NC_011407	TTC	2	6	2122	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
30	NC_011407	TCC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
31	NC_011407	TGC	2	6	2252	2257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
32	NC_011407	ATC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916810
33	NC_011407	T	6	6	2287	2292	0 %	100 %	0 %	0 %	209916810
34	NC_011407	CTG	2	6	2387	2392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
35	NC_011407	TCG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916810
36	NC_011407	CT	4	8	2427	2434	0 %	50 %	0 %	50 %	209916810
37	NC_011407	CCGT	2	8	2460	2467	0 %	25 %	25 %	50 %	209916810
38	NC_011407	TCC	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
39	NC_011407	GTTTC	2	10	2668	2677	0 %	60 %	20 %	20 %	209916810
40	NC_011407	AGGG	2	8	2690	2697	25 %	0 %	75 %	0 %	209916810
41	NC_011407	GTA	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916810
42	NC_011407	CCAC	2	8	2884	2891	25 %	0 %	0 %	75 %	209916810
43	NC_011407	T	7	7	2907	2913	0 %	100 %	0 %	0 %	209916810
44	NC_011407	TCC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209916810
45	NC_011407	CGG	2	6	2969	2974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916810
46	NC_011407	TTC	2	6	3015	3020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
47	NC_011407	CTT	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916810
48	NC_011407	CAG	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916810
49	NC_011407	ATC	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916810
50	NC_011407	GAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916812
51	NC_011407	CCA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916812
52	NC_011407	CAGC	2	8	3320	3327	25 %	0 %	25 %	50 %	209916812
53	NC_011407	CGG	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209916812
54	NC_011407	CGC	2	6	3397	3402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916812
55	NC_011407	GTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916812
56	NC_011407	TCA	3	9	3454	3462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916812
57	NC_011407	C	8	8	3524	3531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_011407	A	6	6	3561	3566	100 %	0 %	0 %	0 %	209916813
59	NC_011407	GCT	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209916813
60	NC_011407	TGA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916813
61	NC_011407	CG	3	6	3706	3711	0 %	0 %	50 %	50 %	209916813
62	NC_011407	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916813
63	NC_011407	GCA	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011407	GCG	2	6	4022	4027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011407	CTCA	2	8	4039	4046	25 %	25 %	0 %	50 %	209916814
66	NC_011407	CGC	2	6	4133	4138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209916814
67	NC_011407	C	6	6	4161	4166	0 %	0 %	0 %	100 %	209916814
68	NC_011407	TGG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011407	TG	3	6	4395	4400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011407	C	6	6	4407	4412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_011407	GCA	2	6	4491	4496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011407	CGGAG	2	10	4517	4526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011407	TAG	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011407	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011407	GAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011407	ACC	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011407	GGT	2	6	4680	4685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011407	T	7	7	4685	4691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011407	ACG	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011407	AAG	2	6	4733	4738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011407	ACT	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916815
82	NC_011407	CAC	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209916815
83	NC_011407	ATCGC	2	10	5014	5023	20 %	20 %	20 %	40 %	209916815
84	NC_011407	TCT	2	6	5062	5067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916815
85	NC_011407	GTT	2	6	5080	5085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209916815
86	NC_011407	GGA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209916815
87	NC_011407	AGT	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916815
88	NC_011407	ATT	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209916815
89	NC_011407	CAG	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209916815
90	NC_011407	CT	3	6	5298	5303	0 %	50 %	0 %	50 %	209916815
91	NC_011407	AGT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209916815
92	NC_011407	TTC	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916815
93	NC_011407	A	7	7	5438	5444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011407	AAC	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011407	AATT	2	8	5707	5714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011407	AGA	2	6	5743	5748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011407	A	7	7	5781	5787	100 %	0 %	0 %	0 %	209916816
98	NC_011407	TCT	2	6	5877	5882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209916816
99	NC_011407	TGG	2	6	5945	5950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209916816
100	NC_011407	TCA	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209916816
101	NC_011407	GAA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209916816
102	NC_011407	ACAT	2	8	6193	6200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011407	CGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011407	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011407	A	6	6	6422	6427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011407	CTT	2	6	6472	6477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011407	ACC	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011407	A	6	6	6698	6703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011407	AG	3	6	6716	6721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011407	AAT	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.